More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2401 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2401  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 
408 aa  826    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.412675  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  56.27 
 
 
390 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
398 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  55.58 
 
 
394 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  56.27 
 
 
392 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 
394 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  56.27 
 
 
391 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
392 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 
392 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
392 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 
394 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  55.41 
 
 
408 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
394 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  55.13 
 
 
394 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
392 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  55.38 
 
 
394 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
392 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  57.11 
 
 
393 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 
390 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  56.19 
 
 
393 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
394 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  57.07 
 
 
394 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
393 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  53.33 
 
 
391 aa  428  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  54.18 
 
 
391 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
392 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
392 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  55.67 
 
 
393 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
393 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
392 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  54.36 
 
 
390 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  54.62 
 
 
390 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  55.38 
 
 
393 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  56.89 
 
 
392 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
392 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  55.38 
 
 
393 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
392 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.87 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.36 
 
 
390 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
392 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
392 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
391 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  55.36 
 
 
393 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 
391 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
393 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 
392 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
391 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
392 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
393 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  54.87 
 
 
390 aa  408  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
395 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
393 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.48 
 
 
390 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
393 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
391 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 
393 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  54.9 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  53.61 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
391 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
393 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
393 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  53.06 
 
 
393 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
392 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
393 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
396 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
393 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
393 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
393 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>