189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2395 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 569 aa  1155    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  35.78 
 
 		 554 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  34.23 
 
 		 550 aa  306  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.61 
 
 		 554 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  33.52 
 
 		 553 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  33.78 
 
 		 607 aa  272  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.23 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.01 
 
 		 554 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.16 
 
 		 585 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.2 
 
 		 583 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  32.04 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.06 
 
 		 572 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31.05 
 
 		 556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  31.22 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.33 
 
 		 578 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.49 
 
 		 567 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.82 
 
 		 561 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  26.41 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  26.41 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  30.65 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  26.05 
 
 		 567 aa  153  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.23 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.06 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.8 
 
 		 590 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  27.17 
 
 		 596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.9 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  28.01 
 
 		 576 aa  147  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.62 
 
 		 574 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.49 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  26.07 
 
 		 576 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  26.09 
 
 		 568 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  26.7 
 
 		 568 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  28 
 
 		 575 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.82 
 
 		 692 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.49 
 
 		 571 aa  123  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 		 692 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  27.03 
 
 		 599 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.96 
 
 		 747 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  26.68 
 
 		 581 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.17 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.95 
 
 		 558 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.59 
 
 		 546 aa  93.6  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.04 
 
 		 559 aa  93.6  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  21.32 
 
 		 585 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.46 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.84 
 
 		 561 aa  87  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.45 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.75 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  24.07 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  23.38 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  22.98 
 
 		 597 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.73 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.81 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.05 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.51 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  26.09 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  22.65 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  24.11 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.52 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.61 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  22.52 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.91 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  21.62 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  24.31 
 
 		 550 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.3 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  25.91 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  22.08 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  22.08 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  24.22 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  24.22 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.94 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  22.71 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  22.94 
 
 		 508 aa  72  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.64 
 
 		 560 aa  72  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.19 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.34 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.43 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  22.98 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.72 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  23.89 
 
 		 555 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.83 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  26.42 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.36 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  22.18 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.31 
 
 		 538 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.05 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  25.91 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.46 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.46 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.22 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.09 
 
 		 582 aa  67  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.49 
 
 		 592 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  23.83 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.74 
 
 		 1349 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>