78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2350 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1105    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  41.93 
 
 		 531 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  42 
 
 		 531 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  42.01 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  42.94 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  41.3 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  41.23 
 
 		 532 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  40.71 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  40.71 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  38.35 
 
 		 556 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 656 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  39.73 
 
 		 547 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  39.32 
 
 		 559 aa  327  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  40.6 
 
 		 529 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  37.2 
 
 		 564 aa  300  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  38.04 
 
 		 558 aa  299  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  42.29 
 
 		 602 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  24.73 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  24.73 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  24.35 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.41 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.55 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 		 509 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  23.64 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  20.91 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  23.77 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.09 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  20.04 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  22.1 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  25.08 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  26.61 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  30.43 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  26.44 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  25.63 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  27.75 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  25.35 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  26.76 
 
 		 513 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.67 
 
 		 244 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  24.38 
 
 		 246 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  25.82 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  25.35 
 
 		 513 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  25.23 
 
 		 259 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.23 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  26.7 
 
 		 250 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.23 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  24.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.23 
 
 		 513 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  22.22 
 
 		 251 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.23 
 
 		 513 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  25.23 
 
 		 513 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  24.53 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 391 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.14 
 
 		 371 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  24.03 
 
 		 257 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  22.73 
 
 		 252 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  22.9 
 
 		 551 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.19 
 
 		 252 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  27.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.44 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  26.72 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  24.2 
 
 		 520 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.44 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  22.47 
 
 		 526 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.15 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.53 
 
 		 274 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  23.44 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25.17 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  30.28 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  38.33 
 
 		 234 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  30.33 
 
 		 610 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  24.43 
 
 		 229 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  25.38 
 
 		 255 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.21 
 
 		 225 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  22.04 
 
 		 221 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  26.21 
 
 		 249 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  33.85 
 
 		 191 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  24.05 
 
 		 202 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>