180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2269 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  100 
 
 
595 aa  1219    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  37 
 
 
600 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  39.07 
 
 
602 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  36.88 
 
 
602 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  35.18 
 
 
586 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  34.28 
 
 
593 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  34.49 
 
 
590 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  34.38 
 
 
598 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  33.84 
 
 
586 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  34.38 
 
 
598 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  33.84 
 
 
586 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  34.38 
 
 
598 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  35.37 
 
 
601 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  34 
 
 
590 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  33.95 
 
 
586 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  33.78 
 
 
586 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  33.78 
 
 
586 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  33.95 
 
 
586 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  34.12 
 
 
582 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  33.78 
 
 
586 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  33.61 
 
 
582 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  33.28 
 
 
594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  32.35 
 
 
594 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  32.42 
 
 
580 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.03 
 
 
596 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  31.76 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  31.86 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  31.7 
 
 
596 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  32.63 
 
 
595 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  32.19 
 
 
592 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  31.05 
 
 
595 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  30.88 
 
 
595 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  31.97 
 
 
604 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  30.88 
 
 
595 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  30.72 
 
 
595 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  32.45 
 
 
596 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  30.68 
 
 
595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.41 
 
 
617 aa  267  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.41 
 
 
617 aa  267  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  27.89 
 
 
613 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  30.73 
 
 
594 aa  257  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  28.35 
 
 
647 aa  240  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  28.19 
 
 
638 aa  239  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  29.66 
 
 
609 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  26.85 
 
 
615 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  27.23 
 
 
600 aa  226  7e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.33 
 
 
622 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  27.47 
 
 
638 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  27.47 
 
 
635 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.88 
 
 
637 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.72 
 
 
637 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  27.56 
 
 
611 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  25.99 
 
 
624 aa  193  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.21 
 
 
607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  27.36 
 
 
607 aa  190  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  25.82 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  26.01 
 
 
641 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  25.55 
 
 
642 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  26.07 
 
 
614 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  24.16 
 
 
586 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  25.21 
 
 
509 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  28.53 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  25.07 
 
 
621 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  22.62 
 
 
621 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  25.07 
 
 
621 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  22 
 
 
630 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  23.65 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  31.48 
 
 
524 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  22.94 
 
 
1009 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  21.36 
 
 
873 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  26.23 
 
 
650 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  21.69 
 
 
450 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  31.58 
 
 
657 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  23.84 
 
 
630 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  23.94 
 
 
656 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  28.32 
 
 
447 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  23.93 
 
 
481 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28.68 
 
 
459 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3501  sulfatase  29.63 
 
 
598 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  30 
 
 
495 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  28.42 
 
 
628 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  28.42 
 
 
628 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  28.42 
 
 
628 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2021  sulfatase  28.78 
 
 
632 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.46218  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  27.87 
 
 
628 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  28.42 
 
 
628 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  27.34 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  28.42 
 
 
628 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  29.45 
 
 
518 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  30 
 
 
495 aa  52.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  28.57 
 
 
1065 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  32.73 
 
 
519 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2755  sulfatase  24.53 
 
 
473 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.8787  normal  0.694021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>