194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2221 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2221  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00681473  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  34.72 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  31.05 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  33 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  32.12 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  32.99 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  31.61 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  31.05 
 
 		 427 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  27.75 
 
 		 416 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  30.53 
 
 		 427 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  30.53 
 
 		 427 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  30.53 
 
 		 427 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  30.53 
 
 		 427 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  29.47 
 
 		 427 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  29.47 
 
 		 427 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  29.47 
 
 		 427 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  31.44 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  32.81 
 
 		 427 aa  94.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  28.65 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  28.95 
 
 		 412 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  31.25 
 
 		 427 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  31.25 
 
 		 427 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  31.25 
 
 		 427 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  31.25 
 
 		 427 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  31.25 
 
 		 427 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  31.94 
 
 		 419 aa  92.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  32.64 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  31.09 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  28.21 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  30.05 
 
 		 429 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  29.02 
 
 		 235 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  29.02 
 
 		 218 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  33.51 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  31.06 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  30.05 
 
 		 426 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  31.25 
 
 		 450 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  32.46 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  31.25 
 
 		 415 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  31.31 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  25.65 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  31.61 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  25.79 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  25.38 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  31.77 
 
 		 450 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  26.56 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  32.46 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  30.53 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  25.26 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  30.05 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  29.02 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  23.16 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1718  paraquat-inducible protein A  33.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604.1  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  23.68 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  26.37 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  25.12 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  28.65 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  26.29 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  23.68 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  28.72 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 423 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  23.56 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  23.56 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  24.85 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  23.56 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  23.16 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  26.15 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  25.64 
 
 		 428 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  25.13 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  25.13 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  23.96 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  24.87 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  24.23 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  27.36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  24.88 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  28.99 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  25.64 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  30.48 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  23.98 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  26.46 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  24.87 
 
 		 460 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  25.89 
 
 		 417 aa  62  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  26.82 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  23.63 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  22.4 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  26.4 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  24.68 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  22.05 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  25.43 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>