More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2198 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  643    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  77.34 
 
 		 310 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  72.95 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  71.63 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  70.45 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  70.45 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  72.07 
 
 		 310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  70.45 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  71.28 
 
 		 311 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  70.45 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  70.1 
 
 		 311 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  72.66 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  70.1 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  72.1 
 
 		 313 aa  447  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  73.82 
 
 		 311 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  70.1 
 
 		 311 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  72.92 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  71.63 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  72.92 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  72.92 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  69.76 
 
 		 311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  72.92 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  71.63 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  72.92 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  71.63 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  71.68 
 
 		 314 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  71.17 
 
 		 313 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  71.69 
 
 		 317 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  73.19 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  64.81 
 
 		 298 aa  411  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  71.21 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  65.85 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  69.92 
 
 		 318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  66.67 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  66.67 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  66.3 
 
 		 322 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  64.21 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  66.3 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  65.45 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  67.03 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  66.3 
 
 		 322 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  66.3 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  63.1 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  65.58 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  65.58 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  65.58 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  64 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  70.59 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  66.54 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  64.36 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  71.08 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  64.36 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  64.73 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  65.71 
 
 		 319 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  63.64 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  69.02 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  61.32 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  63.24 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  66.79 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  59.26 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  64.79 
 
 		 287 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  67.84 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  68.27 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  64.29 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  68.36 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0974  PP-loop domain protein  68.68 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  64.23 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  65.04 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  67.87 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  67.47 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  64.23 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  61.45 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  61.45 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  67.07 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  63.08 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  63.41 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  61.03 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  64.84 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  64.23 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  66.29 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  63.73 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  65.17 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  65.86 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  62.22 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  63.12 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  62.84 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  65.31 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  62.74 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  62.68 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  62.32 
 
 		 316 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  61.82 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>