More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2184 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 		 461 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 		 460 aa  663    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 469 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 459 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 459 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 461 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  67.53 
 
 		 459 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  65.73 
 
 		 459 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 461 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  66.88 
 
 		 459 aa  668    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 459 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 		 462 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 459 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 459 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 459 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 461 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 461 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 460 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 		 461 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  66.88 
 
 		 459 aa  668    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 461 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 461 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 459 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 		 461 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  67.32 
 
 		 460 aa  663    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 461 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  66.88 
 
 		 459 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 459 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 461 aa  969    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  64.79 
 
 		 461 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 461 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 461 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 461 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  65.87 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 461 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 461 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  64.79 
 
 		 465 aa  607  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 		 464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 460 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 485 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 460 aa  539  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 460 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 460 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 459 aa  534  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 455 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 460 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 461 aa  528  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1875  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 462 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000229747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2221  cysteinyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 462 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 461 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 463 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 488 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 473 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  50.62 
 
 		 485 aa  494  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 454 aa  491  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 460 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1167  cysteinyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>