15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2125 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1812  hypothetical protein  64.14 
 
 		 576 aa  755    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1201    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164026  decreased coverage  0.000906095 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1237  hypothetical protein  62.84 
 
 		 576 aa  731    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05507  hypothetical protein  70.07 
 
 		 577 aa  821    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0816  hypothetical protein  59.89 
 
 		 572 aa  705    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0874  hypothetical protein  72.82 
 
 		 566 aa  857    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.567191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001566  hypothetical protein  71.65 
 
 		 578 aa  858    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3061  hypothetical protein  48.19 
 
 		 564 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.603278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2691  hypothetical protein  48.19 
 
 		 572 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.771484  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3867  hypothetical protein  42.37 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3384  hypothetical protein  38.77 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0580  hypothetical protein  38.91 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1603  hypothetical protein  38.48 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.180053  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3731  hypothetical protein  29.23 
 
 		 578 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1963  hypothetical protein  28.17 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250891  normal  0.249477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>