More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1887 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1887  transcriptional regulator of LysR family protein  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  0.0439695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4666  LysR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 307 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3930  LysR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 314 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3174  LysR family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3864  LysR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 306 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.163001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0035  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4568  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00026007  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3696  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0773  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0684  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0640  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148889  hitchhiker  0.000410503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0595  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.872616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0635  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210235  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0677  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.13 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3663  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0209  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.150203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01640  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262408  normal  0.919946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5706  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0443967  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6363  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4053  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.93 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0100  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6273  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.62 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0608  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4285  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1124  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1630  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.48911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0374  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1455  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1381  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.727507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1008  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0495  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0155  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4743  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3728  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1095  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4202  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0903744 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2317  LysR family regulatory protein  30.1 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1699  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1659  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6019  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4054  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3205  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4295  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4312  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4102  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1579  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3454  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0380  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4038  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3519  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4436  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00650478  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03780  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2851  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2197  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4522  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4028  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  0.0962956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1389  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3814  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46060  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3917  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1458  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0785  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352567  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5172  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2060  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4378  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1618  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0301028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1799  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0309251  normal  0.330495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3104  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4643  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49590  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0638  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.327526  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4985  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5283  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3084  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3437  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5195  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1551  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1040  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0665507  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1596  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2574  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.475396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1997  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2242  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2155  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0675  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3439  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1540  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5120  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2782  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0637  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4054  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2149  transcriptional regulator, LysR family  24.01 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.463348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2962  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02726  transcriptional regulator, LysR family protein  27.37 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4499  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1818  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2194  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0690526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3543  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1724  transcriptional regulator, LysR family  23.51 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>