111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1790 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  100 
 
 		 176 aa  361  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  29.48 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 191 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 191 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  30.9 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 205 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 191 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.21 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 193 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 600 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 216 aa  80.9  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  23.26 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  38 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 510 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  23.03 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 291 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 209 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
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NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
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