46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1735 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  357  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  35.84 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  31.58 
 
 
175 aa  90.9  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  35.03 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  29.73 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  28.02 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  25.41 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  29.7 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  27.22 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  24.86 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  28.32 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  24.86 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  24.86 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  24.86 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  27.75 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  25.14 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  21.31 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  24.02 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  24.59 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  29.81 
 
 
186 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  26.74 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  26.74 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  22.22 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  28.9 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  29.14 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  28.66 
 
 
196 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  25.42 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  27.43 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  27.88 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  24.86 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  24.26 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  25.9 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  26.78 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  26.06 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  24.85 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  22.99 
 
 
173 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  26.04 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  25.16 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0875  hypothetical protein  25.82 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000548389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  24.56 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  21.26 
 
 
174 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  25.79 
 
 
192 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>