52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1718 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  100 
 
 		 421 aa  838    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  64.69 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  65.49 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  51.75 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  53.96 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  48.79 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  50 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  50.86 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  50.86 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  50.61 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  50.61 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  48.05 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  47.8 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  48.76 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  49.29 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  50.37 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  44.47 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  44.95 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  48.64 
 
 		 433 aa  352  7e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  48.95 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  43.68 
 
 		 419 aa  332  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  44.98 
 
 		 420 aa  325  9e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  42.2 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  43.11 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.02 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.22 
 
 		 421 aa  257  3e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  35.34 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  33.94 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  34.92 
 
 		 434 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  33.94 
 
 		 437 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  35.14 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  35.65 
 
 		 418 aa  226  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  34.2 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  34.29 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  34.29 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  31.38 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  35.58 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  32.55 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  35.35 
 
 		 460 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.3 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  25.81 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  20.42 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  21.74 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  22.01 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  23.98 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  22.49 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  57.89 
 
 		 52 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  25.07 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  22.34 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  26.18 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.52 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.53 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>