More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1681 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  47.12 
 
 		 376 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  45.48 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  45.48 
 
 		 369 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  45.18 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  42.63 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  44.98 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  40.79 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  41.76 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  41.1 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  41.76 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  40.84 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  40.93 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  39.56 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  40.13 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  40.74 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.37 
 
 		 413 aa  249  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  37.09 
 
 		 378 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  39.12 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.89 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  37.27 
 
 		 377 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.97 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  37.43 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.3 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.63 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  39.08 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  38.48 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  37.18 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.44 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.14 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  35.83 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  35.09 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  39.34 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  38.18 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  35.18 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  39.02 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  38.07 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  34.75 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  37.35 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  37.88 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  39.07 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  35.17 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  37.5 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  37.02 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  35.83 
 
 		 377 aa  225  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  36.6 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  36.12 
 
 		 385 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  38.8 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  36.91 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  36.87 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  37.6 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  36.64 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  34.79 
 
 		 376 aa  222  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  37.33 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  35.34 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  36.75 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  36.46 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  35.81 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  32.63 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  35.16 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  38.62 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  42.86 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  33.51 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  34.67 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  37.23 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  36.58 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  36.58 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  34.54 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  36.01 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  34.11 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  34.82 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  37.76 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  34.53 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  34.22 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  34.73 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  34.46 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  37.4 
 
 		 377 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  36.62 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  33.69 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  33.95 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  34.72 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  37.19 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  35.93 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 366 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 366 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  31.88 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  33.78 
 
 		 368 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  34.26 
 
 		 474 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  34.4 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  33.42 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  34.45 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>