173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1603 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  63.38 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  62.68 
 
 		 147 aa  194  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  193  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  193  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  60.69 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  60.69 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  60.69 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  60.69 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  60.69 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  60.69 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  61.27 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  58.33 
 
 		 144 aa  189  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  61.27 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  61.27 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  61.27 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  63.64 
 
 		 146 aa  189  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  60.56 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  58.74 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  57.75 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  57.64 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  59.86 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  59.15 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  59.15 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  57.64 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  56.55 
 
 		 148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  56.55 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  58.45 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  58.45 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  57.75 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  57.75 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  56.34 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  57.75 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  57.75 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  57.75 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  57.04 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  57.04 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  57.04 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  57.04 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  55.63 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  56.34 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  52.45 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  54.93 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  53.52 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  51.41 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  47.22 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  53.85 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  46.9 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  48.23 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  50.35 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  47.52 
 
 		 144 aa  149  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  46.48 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  48.18 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  46.81 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  48.18 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  48.18 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  48.23 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  47.52 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  45.71 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  47.52 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  46.85 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  45.45 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  43.45 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  43.84 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  44.76 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  42.96 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  44.76 
 
 		 144 aa  137  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  43.36 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  40.28 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2058  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 155 aa  127  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806179 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  39.86 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  39.86 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1617  hypothetical protein  39.22 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.441973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  37.76 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  39.73 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  41.5 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  41.1 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  39.16 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  41.5 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1144  cyclase/dehydrase  38.85 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  39.16 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  40.82 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>