86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1592 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  80.86 
 
 		 307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  79.34 
 
 		 306 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  75.41 
 
 		 305 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  75.08 
 
 		 305 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  74.43 
 
 		 305 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  74.75 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  73.93 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  74.1 
 
 		 305 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  73.93 
 
 		 306 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  73.93 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  73.75 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.61 
 
 		 306 aa  474  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  77.12 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  72.28 
 
 		 307 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  71.95 
 
 		 307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  75.99 
 
 		 309 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.33 
 
 		 304 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  75.25 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.56 
 
 		 306 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  69.13 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.28 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.89 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.55 
 
 		 303 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  65.86 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.92 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  63.55 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  60.47 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.39 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.27 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  62.03 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.16 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  63.7 
 
 		 319 aa  367  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.46 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.46 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  41.64 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  40.79 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  38.33 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  35.15 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  37.99 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.3 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.8 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  35.4 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  37.5 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  40.15 
 
 		 342 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.56 
 
 		 277 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  39.48 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  36.36 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.85 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.32 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.4 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  38.61 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  35.82 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  36.71 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  35.77 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  33.71 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  33.71 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  35.69 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  34.09 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  34.75 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  33.09 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.13 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  34.05 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.57 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.14 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  34.3 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  32.97 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  31.9 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  67.07 
 
 		 130 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  23.39 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  21.61 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24 
 
 		 545 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  22.36 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.73 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.77 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  25.59 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  21.97 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.61 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.7 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.45 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.08 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  25.8 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  26.8 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.99 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.77 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>