28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1445 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  59.66 
 
 
234 aa  291  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.04269e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  58.65 
 
 
246 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  58.65 
 
 
246 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  58.65 
 
 
246 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  57.81 
 
 
234 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  58.23 
 
 
246 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  59.73 
 
 
234 aa  288  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  58.65 
 
 
234 aa  287  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  59.41 
 
 
235 aa  286  3e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  57.81 
 
 
234 aa  284  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  57.81 
 
 
234 aa  283  1e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  58.58 
 
 
235 aa  282  3e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  59.41 
 
 
234 aa  281  6e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.17623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  58.65 
 
 
234 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  56.54 
 
 
233 aa  278  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  56.12 
 
 
235 aa  278  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  57.38 
 
 
234 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  55.46 
 
 
241 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  58.56 
 
 
236 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  55.41 
 
 
246 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  55.7 
 
 
232 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.81321e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  55.91 
 
 
234 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  53.97 
 
 
234 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  46.64 
 
 
236 aa  205  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  46.84 
 
 
236 aa  181  9e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2056  hypothetical protein  21.69 
 
 
425 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0262508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0102  hypothetical protein  23.53 
 
 
428 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>