275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1420 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
486 aa  1017    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  63.79 
 
 
479 aa  621  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  65.29 
 
 
480 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  61.59 
 
 
481 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  63.68 
 
 
481 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  61.97 
 
 
481 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  63.73 
 
 
481 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  61.76 
 
 
481 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  65.08 
 
 
492 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  63.3 
 
 
477 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  61.13 
 
 
481 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  63.07 
 
 
484 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  62.16 
 
 
482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  62.5 
 
 
480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  55.89 
 
 
480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  55.05 
 
 
475 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  54.31 
 
 
475 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.32 
 
 
484 aa  501  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  42.77 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  42.59 
 
 
475 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  42.98 
 
 
470 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  43.91 
 
 
474 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 
464 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  41.92 
 
 
479 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  41.92 
 
 
479 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  42.55 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  42.55 
 
 
470 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  41.7 
 
 
479 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 
473 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.95 
 
 
463 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  41.3 
 
 
469 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  41.39 
 
 
469 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.92 
 
 
470 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  41.09 
 
 
471 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  43.37 
 
 
470 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  39.62 
 
 
475 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  39.62 
 
 
475 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  41.05 
 
 
469 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  39.41 
 
 
475 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  39.62 
 
 
475 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  43.22 
 
 
470 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  40.5 
 
 
470 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  39.62 
 
 
475 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.62 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  39.62 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.62 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  39.2 
 
 
475 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  39.83 
 
 
470 aa  363  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  40.08 
 
 
471 aa  362  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.58 
 
 
536 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  40.58 
 
 
483 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  40.58 
 
 
483 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.58 
 
 
483 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  40.58 
 
 
483 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  41.35 
 
 
479 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.67 
 
 
475 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  40.58 
 
 
483 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  40.55 
 
 
470 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  40.37 
 
 
483 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.21 
 
 
470 aa  360  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  39.87 
 
 
471 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  40.34 
 
 
476 aa  358  8e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  41.88 
 
 
473 aa  358  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  40.72 
 
 
470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  40.43 
 
 
472 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 
473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.34 
 
 
470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  40.38 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.38 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.35 
 
 
473 aa  356  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  41.46 
 
 
473 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  40.45 
 
 
482 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  41.46 
 
 
473 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  38.53 
 
 
478 aa  355  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  39.12 
 
 
470 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  40.81 
 
 
479 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  41.25 
 
 
473 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  40.45 
 
 
477 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  41.46 
 
 
473 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40.45 
 
 
477 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  40.66 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  40.66 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  46.13 
 
 
498 aa  353  5e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  41.12 
 
 
512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  40.29 
 
 
522 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  40.25 
 
 
482 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39 
 
 
480 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.96 
 
 
479 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  40.72 
 
 
471 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  40.64 
 
 
493 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12940  (4Fe-4S) cluster-containing protein  42.71 
 
 
509 aa  350  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  40.64 
 
 
493 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  40.69 
 
 
494 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  40.76 
 
 
489 aa  349  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>