198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1419 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  40.36 
 
 
235 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  41.59 
 
 
235 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  40.54 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  41.78 
 
 
222 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  39.81 
 
 
228 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  40.55 
 
 
224 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  38.57 
 
 
223 aa  154  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  39.65 
 
 
236 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  40.17 
 
 
244 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  38.74 
 
 
223 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  38.39 
 
 
223 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  43.48 
 
 
241 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  44.02 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  39.27 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  39.13 
 
 
223 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  52.59 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  50.85 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  42.34 
 
 
205 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  31.31 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  35.2 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  31.31 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  35.2 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  34.4 
 
 
218 aa  89  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  32.43 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  33.96 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  36.97 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  37.5 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  38.95 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  31.62 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  36 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  40.45 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  41.67 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  43 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  31.03 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  38.61 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  39.8 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  29.27 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  36.36 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  39.8 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  39.8 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  41.18 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  39.8 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  39.8 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  39.8 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  39.8 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  35.85 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  39.58 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  39.58 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  29.13 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  42.57 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  39.22 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  41 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  34 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  36.27 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  35.59 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  39 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.46 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.63 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  35.51 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  36.27 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  36.27 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  32.71 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  36.27 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  32.69 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  36.27 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  34 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  36.08 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  34.02 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  28.51 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  32.99 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  34.19 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  32.99 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  32.99 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  36.08 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  32.99 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  32.99 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  31.9 
 
 
426 aa  68.2  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  36.08 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  24.73 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  36.08 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  36.08 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  36.08 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  35.05 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  35.11 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  31.19 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  28.08 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  34.74 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  38 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  36.27 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  31.96 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  34.38 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  34.07 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  34.69 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  32.14 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>