More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1334 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3929  patatin  50.63 
 
 
737 aa  733    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  50.48 
 
 
738 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  51.49 
 
 
734 aa  741    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  52.01 
 
 
735 aa  787    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  51.39 
 
 
736 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  50.35 
 
 
738 aa  732    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  50.35 
 
 
738 aa  732    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  51.25 
 
 
738 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  50.62 
 
 
735 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  100 
 
 
745 aa  1510    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  53.3 
 
 
738 aa  809    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  51.74 
 
 
737 aa  745    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  51.68 
 
 
751 aa  768    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  51.59 
 
 
738 aa  744    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  51.59 
 
 
738 aa  743    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  50.34 
 
 
737 aa  741    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  51.48 
 
 
754 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  50.62 
 
 
739 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  35.31 
 
 
776 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  35.11 
 
 
771 aa  432  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  35.37 
 
 
764 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.73 
 
 
751 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.92 
 
 
727 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.2 
 
 
728 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  33.71 
 
 
745 aa  359  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.74 
 
 
748 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  33.24 
 
 
741 aa  355  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.1 
 
 
728 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.21 
 
 
733 aa  349  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.4 
 
 
728 aa  347  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.75 
 
 
728 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  31.66 
 
 
750 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.43 
 
 
753 aa  337  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.8 
 
 
728 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.26 
 
 
777 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  31.1 
 
 
790 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.36 
 
 
767 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  31.07 
 
 
728 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  31.07 
 
 
933 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  31.07 
 
 
945 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  31.12 
 
 
920 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  31.12 
 
 
930 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.71 
 
 
798 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.92 
 
 
803 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  31.63 
 
 
803 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  31.63 
 
 
803 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.22 
 
 
796 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.05 
 
 
852 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  31.2 
 
 
804 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  30.51 
 
 
714 aa  290  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.79 
 
 
813 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  35.4 
 
 
667 aa  278  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  29.61 
 
 
729 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  36.73 
 
 
760 aa  227  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  25.16 
 
 
733 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  27.45 
 
 
720 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  32.33 
 
 
740 aa  201  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.2 
 
 
740 aa  194  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.57 
 
 
746 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  36 
 
 
923 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  39.79 
 
 
900 aa  181  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  35.2 
 
 
909 aa  180  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  36.31 
 
 
950 aa  177  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  38.41 
 
 
981 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  28.37 
 
 
707 aa  170  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  37.59 
 
 
894 aa  170  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  37.04 
 
 
263 aa  165  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  37.59 
 
 
875 aa  164  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.76 
 
 
260 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  29.25 
 
 
775 aa  157  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  33.33 
 
 
256 aa  157  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  36.55 
 
 
263 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  36.52 
 
 
263 aa  156  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  36.21 
 
 
263 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  36.21 
 
 
263 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  36.21 
 
 
263 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  36.21 
 
 
263 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  36.52 
 
 
263 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.44 
 
 
311 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.71 
 
 
320 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.81 
 
 
263 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  36.07 
 
 
263 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.02 
 
 
263 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.72 
 
 
272 aa  148  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.06 
 
 
259 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.66 
 
 
320 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.66 
 
 
320 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  33.66 
 
 
333 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  34.9 
 
 
330 aa  144  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.17 
 
 
253 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  32.58 
 
 
346 aa  144  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  36.56 
 
 
262 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.22 
 
 
273 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.45 
 
 
275 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  32.08 
 
 
310 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.28 
 
 
293 aa  138  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.13 
 
 
302 aa  137  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.04 
 
 
323 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.23 
 
 
275 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.1 
 
 
275 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>