More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1310 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  100 
 
 		 210 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  52.53 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  41.79 
 
 		 204 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  45.1 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  44.81 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  43.72 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  39.9 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  40.98 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  40.98 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  40.98 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  40.98 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  41.62 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  41.08 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  41.24 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.11 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.45 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.42 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  36.1 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  34.56 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  37.02 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  33.69 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.61 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.61 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.61 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.61 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.61 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.61 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.61 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  34.63 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.64 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.99 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.42 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  36.46 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  36.02 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  32.68 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.16 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  32.09 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.6 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  36.87 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.78 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  32.12 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.97 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  32.24 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  34.39 
 
 		 257 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  30.9 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30.81 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  31.6 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  34.43 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  34.09 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  30.81 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 242 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  32.39 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 260 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  33.91 
 
 		 267 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  29.57 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.35 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  30.95 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  34.44 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  34.09 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  31.61 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  35.91 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  31.84 
 
 		 271 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  35.36 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  33.33 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  34.09 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  35.36 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  30.94 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  32 
 
 		 283 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.39 
 
 		 318 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  32.4 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  32.46 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  34.16 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 236 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.88 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  31.41 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  31.82 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  31.82 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  34.81 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  31.61 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  31.82 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>