79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1309 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  100 
 
 		 346 aa  728    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  63.72 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  58.77 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  59.36 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  58.33 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  58.05 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  58.77 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  57.76 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  57.47 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  59.51 
 
 		 352 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  58.19 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  60.25 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  57.43 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  44.8 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  47.25 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  43.99 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  44.61 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  47.12 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  44.28 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  43.99 
 
 		 304 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  46.5 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  48.14 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  44 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  43.67 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  40 
 
 		 343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  40.72 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  41.16 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  37.64 
 
 		 272 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  34.73 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  33.21 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  32.19 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  32.19 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  34.63 
 
 		 773 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  33.56 
 
 		 669 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  31.99 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  33.57 
 
 		 691 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.45 
 
 		 689 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  34.31 
 
 		 675 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  34.59 
 
 		 675 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  35.04 
 
 		 728 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  31.51 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  30.63 
 
 		 698 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.24 
 
 		 699 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  33.45 
 
 		 712 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  33.21 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  33.6 
 
 		 708 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  30.47 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  32.84 
 
 		 721 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  31.85 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  31.84 
 
 		 694 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  31.84 
 
 		 721 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  33.61 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  30.92 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.07 
 
 		 726 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  31.56 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  33.59 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  31.12 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  27.42 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  27.41 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  29.68 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  26.96 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  49.04 
 
 		 139 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  27.07 
 
 		 671 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  25.8 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  27.24 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  50.63 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  38.84 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.48 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  47.22 
 
 		 79 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  22.66 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  22.66 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  22.66 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 136 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  27.47 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  28.92 
 
 		 280 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>