36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1260 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 74 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  55.1 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  46.67 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  48.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  45.24 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  44.23 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  44.23 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  44.23 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  46.34 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  34.48 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  40.48 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  43.75 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  37.74 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  33.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  35.19 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  40.48 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  30.65 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  39.53 
 
 		 126 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  36.36 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  39.53 
 
 		 98 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  35.29 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  29.63 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  36.36 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  41.86 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  41.86 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  39.02 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  32.08 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  34.88 
 
 		 134 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.88 
 
 		 72 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>