14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1249 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.03 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0070  hypothetical protein  22.45 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0872353  hitchhiker  0.00188887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0705  hypothetical protein  27.64 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.61 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2407  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.67 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.797019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1802  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.12 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.49 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  20 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.78 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.58 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.16 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.65 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>