28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1214 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  38.06 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  38.36 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  39.19 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  41.33 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  35.86 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  34.53 
 
 		 164 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  39.68 
 
 		 156 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  32.61 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  28.77 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.41 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  25.83 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  25.87 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  27.27 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  23.24 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  23.24 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  25.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  24.83 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  29.87 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  24.36 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  27.16 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>