17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1181 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1181  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0644392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  28.91 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  28.57 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  28.99 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  27.05 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  30 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  29.22 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  28.21 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  27.1 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  31.03 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  26.96 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  33.33 
 
 		 98 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  26.8 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3312  resolvase-like protein  31.58 
 
 		 239 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.3 
 
 		 539 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  29.31 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>