249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1130 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  100 
 
 		 208 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  56.73 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  47.34 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  47.34 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  48.31 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  46.38 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  47.34 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  46.38 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  46.86 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  46.86 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  50.24 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  50.72 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  50.24 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  47.6 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  47.12 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  49.76 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  48.08 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  49.52 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  50 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  49.52 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  49.04 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  47.34 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  48.8 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  48.08 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  46.86 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  48.56 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  49.52 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  50.48 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  43.41 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  52.88 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  42 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  41.87 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  42.93 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  41.79 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  40.69 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  45.59 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  39.71 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  42.5 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  37.69 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  39.22 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  36.76 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  38.24 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  38.24 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  38.24 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  38.24 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  38.24 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  43.56 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  36.76 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  39.22 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  38.24 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  39.81 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  42.29 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  37.56 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  39 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  37.2 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  40.49 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  40.5 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  35.61 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  39.41 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  37.44 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  39.41 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  38.92 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  38.92 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  38.92 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  38.92 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  38.92 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  39.41 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  38.92 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  35.64 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  40.2 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  39.42 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  37.75 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  40.49 
 
 		 217 aa  137  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  39.23 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  37.31 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>