More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0976 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1777  putative molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein ModF  78.87 
 
 
459 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0976  ABC transporter for molybdenum ATP-binding protein ModF  100 
 
 
459 aa  946    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  39.26 
 
 
491 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  36.85 
 
 
475 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001511  ABC transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
484 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1266  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.09 
 
 
491 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3068  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.26 
 
 
491 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1251  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.82 
 
 
490 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2885  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  40.05 
 
 
489 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  36.74 
 
 
489 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.81 
 
 
488 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2853  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.2 
 
 
496 aa  279  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1415  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.42 
 
 
497 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2940  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  39.42 
 
 
496 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  38.21 
 
 
490 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1407  ABC transporter related  36.23 
 
 
489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.740613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0783  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.77 
 
 
490 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2902  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.56 
 
 
490 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.575646  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.77 
 
 
490 aa  272  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2882  ABC transporter related protein  36.56 
 
 
490 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0643472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  36.2 
 
 
497 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0863  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.77 
 
 
490 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0496449  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0787  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.56 
 
 
490 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0681  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.34 
 
 
490 aa  269  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0814  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.55 
 
 
491 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0905  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.55 
 
 
491 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0873  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.55 
 
 
491 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1570  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
485 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0842  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.55 
 
 
491 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0928  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  37.55 
 
 
491 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0684  ABC transporter related  35.96 
 
 
498 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0675  ABC transporter related  35.75 
 
 
498 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3701  ABC transporter related  35.67 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0576  ABC transporter related  34.34 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3377  ABC transporter related  34.34 
 
 
495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0654  ABC transporter related  35.53 
 
 
498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3547  ABC transporter related  34.05 
 
 
496 aa  253  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01177  putative anion transport protein (ABC superfamily, ATP-binding protein)  33.91 
 
 
497 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.912331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0726  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0686  ABC transporter related  35.34 
 
 
492 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3423  ABC transporter related  30.5 
 
 
497 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191303  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05449  molybdenum transporter ATP-binding subunit modF  54.89 
 
 
198 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  30.58 
 
 
500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2622  ABC transporter related  34.95 
 
 
413 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  27.64 
 
 
499 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4947  ABC transporter related protein  29.36 
 
 
482 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3635  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 
501 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  26.19 
 
 
514 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  25.57 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49011  predicted protein  27.91 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  26.26 
 
 
562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  27.35 
 
 
500 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  27.07 
 
 
479 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  26.33 
 
 
636 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  28.08 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  35.07 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
275 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  28.17 
 
 
479 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  26.96 
 
 
483 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  33.49 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1986  ABC transporter related  26.32 
 
 
501 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.45926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.57 
 
 
272 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  34.23 
 
 
280 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.69 
 
 
263 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  30.92 
 
 
239 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  35.19 
 
 
283 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  32.99 
 
 
275 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  32.86 
 
 
263 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  34.02 
 
 
262 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  33.16 
 
 
262 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  33.5 
 
 
262 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  30.66 
 
 
267 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  30.35 
 
 
260 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  30.35 
 
 
260 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.95 
 
 
260 aa  94.4  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  24.89 
 
 
456 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
254 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  29.13 
 
 
262 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  33.78 
 
 
262 aa  94  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  24.89 
 
 
456 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
254 aa  93.6  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
260 aa  93.6  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  30.37 
 
 
268 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  30.59 
 
 
278 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  28.74 
 
 
501 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  24.61 
 
 
456 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  27.36 
 
 
262 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  30.8 
 
 
620 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.23 
 
 
464 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 
290 aa  90.9  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  28.5 
 
 
265 aa  90.5  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  28.44 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.5 
 
 
263 aa  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  34.52 
 
 
254 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  31.13 
 
 
271 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  30.88 
 
 
271 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  29.36 
 
 
265 aa  89  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.09 
 
 
274 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45404  predicted protein  23.11 
 
 
635 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  26.67 
 
 
336 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>