106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0955 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  56.74 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  57.45 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  52.82 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  46.9 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  48.61 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  48.61 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  49.3 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  50.7 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  50.7 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  50.7 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  50.7 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  50.7 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  49.3 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  49.3 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  47.89 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  48.59 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  48.59 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  48.59 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  44.68 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  47.14 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  47.52 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  46.43 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  36.62 
 
 		 189 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  37.58 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  36.05 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  36.05 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  36.05 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  36.05 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  36.05 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  33.1 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  32.89 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  28.08 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  33.11 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  28.38 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.79 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  28.48 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  28.48 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  27.4 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  25.17 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  26.53 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  26.03 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  25.17 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  27.91 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  25.34 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  26.9 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  26.71 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  27.56 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  25.34 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  28.47 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  29.55 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.57 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>