More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0893 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  49.13 
 
 		 706 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  47.12 
 
 		 693 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  53.08 
 
 		 774 aa  811    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  48.84 
 
 		 708 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  56.58 
 
 		 721 aa  831    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  48.18 
 
 		 694 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  51.08 
 
 		 693 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  50.22 
 
 		 694 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  50.22 
 
 		 694 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  48.14 
 
 		 671 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  49.21 
 
 		 695 aa  656    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  48.09 
 
 		 705 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  51.02 
 
 		 697 aa  731    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 693 aa  1446    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  47.61 
 
 		 724 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  45.49 
 
 		 696 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  45.66 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  45.78 
 
 		 706 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 		 723 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 		 718 aa  567  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  43.02 
 
 		 729 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  42.4 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  44.24 
 
 		 710 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 		 708 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.92 
 
 		 707 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  41.61 
 
 		 718 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  42.58 
 
 		 706 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 711 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.39 
 
 		 720 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  42.29 
 
 		 703 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  41.74 
 
 		 683 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.52 
 
 		 690 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  41.24 
 
 		 723 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 		 705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  40.66 
 
 		 709 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 		 751 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  40.59 
 
 		 711 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  40.88 
 
 		 713 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  42.05 
 
 		 722 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 712 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  42.32 
 
 		 726 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  40.61 
 
 		 714 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  40.75 
 
 		 714 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.83 
 
 		 720 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  38.41 
 
 		 1537 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  40.75 
 
 		 714 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 708 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.75 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  40 
 
 		 730 aa  505  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  39.74 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  41.17 
 
 		 727 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  40.83 
 
 		 701 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  41.49 
 
 		 708 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  40.69 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 709 aa  501  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  41.84 
 
 		 710 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  39.65 
 
 		 752 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  40.52 
 
 		 704 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  41.16 
 
 		 721 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.16 
 
 		 701 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  38.66 
 
 		 776 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  39.61 
 
 		 715 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.22 
 
 		 722 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  40.31 
 
 		 714 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.84 
 
 		 755 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  40.41 
 
 		 707 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  40.49 
 
 		 701 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  39.01 
 
 		 720 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  40.78 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  39.01 
 
 		 722 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  40.53 
 
 		 715 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  39.42 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  40.97 
 
 		 703 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  39.01 
 
 		 720 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 		 721 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  38.48 
 
 		 712 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  39.81 
 
 		 718 aa  484  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  39.94 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 758 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  39.53 
 
 		 729 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  38.62 
 
 		 712 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  40.66 
 
 		 779 aa  485  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  41.09 
 
 		 758 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.42 
 
 		 1464 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  40.5 
 
 		 756 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  39.24 
 
 		 733 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  38.2 
 
 		 712 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  39.47 
 
 		 711 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  40.56 
 
 		 779 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  39.77 
 
 		 718 aa  482  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  38.16 
 
 		 689 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  39.6 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  40.11 
 
 		 715 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  38.38 
 
 		 721 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  38.29 
 
 		 704 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  38.73 
 
 		 701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 716 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  39.66 
 
 		 720 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  40.77 
 
 		 716 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>