40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0892 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  100 
 
 
210 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  37.5 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  36.04 
 
 
162 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  34.15 
 
 
162 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  29.6 
 
 
168 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  35.51 
 
 
161 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  31.3 
 
 
158 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  36 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  36 
 
 
161 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  35.05 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  34.02 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  33 
 
 
161 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  27.78 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  33 
 
 
161 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  33 
 
 
161 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  26.17 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  26.17 
 
 
174 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  32 
 
 
161 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  32 
 
 
161 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  29.67 
 
 
154 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  31.03 
 
 
170 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  35.53 
 
 
1446 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  27.97 
 
 
174 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  33 
 
 
156 aa  45.1  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  33 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04787  hypothetical protein  31.37 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2871  hypothetical protein  27.74 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000939154  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  32 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  31.31 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  32 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  26.85 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  31.48 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  26.32 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3273  hypothetical protein  28.29 
 
 
151 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00343994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  30.7 
 
 
157 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  32.65 
 
 
163 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  33 
 
 
166 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  25 
 
 
174 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  31.07 
 
 
162 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>