69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0887 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  75.23 
 
 		 431 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  76.63 
 
 		 442 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  76.23 
 
 		 441 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 446 aa  878    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  75.81 
 
 		 425 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  65.62 
 
 		 439 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  67.26 
 
 		 445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  64.88 
 
 		 440 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  65.25 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  63.6 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  65.02 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  65.47 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  65.02 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  65.02 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  65.02 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  65.02 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  65.17 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  65.02 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  61.57 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  63.76 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  67.34 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  64.57 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  63.68 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  57.08 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  60.8 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  54.83 
 
 		 439 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  55.06 
 
 		 439 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  54.61 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  54.61 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  59.28 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  54.16 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  55.06 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  57.75 
 
 		 439 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  54.83 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  54.83 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  54.83 
 
 		 439 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  55.06 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  54.83 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  59.06 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  57.53 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  58.2 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  58.88 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  53.3 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  56.85 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  51.72 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  59.1 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  47.88 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  48.43 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  48.43 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  48.43 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  46.33 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  48.87 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  50 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  47.75 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  48.43 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  43.24 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  44.95 
 
 		 455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.37 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  43.69 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  44.59 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  41.09 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  39.52 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  31.11 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1163  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.64 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963598 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.4 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.25 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.89 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  27.63 
 
 		 521 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  27.89 
 
 		 571 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>