30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0762 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  805    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  25.96 
 
 
491 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  25.96 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  25.96 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  25.96 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  26.19 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  25.52 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  25.58 
 
 
499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  25.05 
 
 
497 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  25.75 
 
 
490 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  25.43 
 
 
490 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  25.97 
 
 
490 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  24.67 
 
 
494 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  25.22 
 
 
491 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  26.41 
 
 
494 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  21.94 
 
 
494 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  23.1 
 
 
499 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  24.47 
 
 
501 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  24.86 
 
 
444 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  27.73 
 
 
487 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  23.82 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  25.15 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  24.89 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  22.13 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  23.05 
 
 
512 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  23.48 
 
 
477 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  22.41 
 
 
483 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  21.05 
 
 
497 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  22.35 
 
 
492 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  23.58 
 
 
504 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>