More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0662 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.38 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.97 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.45 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.45 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  54.45 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.91 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.37 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  50.82 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  54.1 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  55.19 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  54.1 
 
 		 196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  50.54 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  53.06 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  54.1 
 
 		 196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  49.73 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  53.55 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  53.01 
 
 		 196 aa  208  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  52.46 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.55 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  51.91 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  52.46 
 
 		 198 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  52.46 
 
 		 198 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  52.46 
 
 		 198 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  50.82 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  51.91 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  53.01 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  53.01 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.97 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.39 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  50.82 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  50.83 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  46.45 
 
 		 222 aa  188  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  49.17 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.5 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  45.29 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  45.88 
 
 		 171 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  44.71 
 
 		 176 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  41.18 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  42.14 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  36.42 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.95 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  39.53 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  41.14 
 
 		 171 aa  125  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.37 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  40.49 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  36.63 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.21 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  40.54 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  42.36 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  38.95 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  43.67 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  36.47 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  38.37 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  43.42 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  42.41 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  35.58 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  41.89 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  40.28 
 
 		 154 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  38.37 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  38.37 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  37.21 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  37.79 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2793  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.84 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000628922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  40.82 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  37.21 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  37.21 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  39.58 
 
 		 157 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  38.78 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  41.61 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.1 
 
 		 166 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  37.5 
 
 		 173 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  40.94 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  40.94 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  41.67 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  35.76 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  42.28 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  38.95 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  34.71 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  40.27 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  38.37 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  35.33 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  34.71 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  40.97 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  32.78 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  34.46 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  40.27 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  40.27 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  35.15 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  40.27 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  40.27 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.22 
 
 		 163 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  37.85 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  34.1 
 
 		 175 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  41.18 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  38.36 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>