239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0643 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.37 
 
 
243 aa  347  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.96 
 
 
243 aa  345  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.14 
 
 
243 aa  345  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  67.36 
 
 
243 aa  335  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.03 
 
 
245 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.03 
 
 
250 aa  335  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  334  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
243 aa  333  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.67 
 
 
246 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  66.53 
 
 
243 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.77 
 
 
243 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.77 
 
 
243 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.77 
 
 
243 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  328  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  66.94 
 
 
243 aa  328  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.08 
 
 
243 aa  327  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.67 
 
 
243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
243 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
243 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
243 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
243 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.77 
 
 
243 aa  326  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.12 
 
 
243 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.62 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.03 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.62 
 
 
245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.44 
 
 
245 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.62 
 
 
245 aa  318  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.62 
 
 
245 aa  317  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3023  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  316  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.316333  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.21 
 
 
245 aa  315  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.39 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1151  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.57 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.15 
 
 
270 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.29 
 
 
265 aa  293  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.85 
 
 
243 aa  290  1e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  60.83 
 
 
250 aa  289  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
248 aa  289  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.5 
 
 
248 aa  286  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 
248 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.25 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.76 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.74 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.74 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.83 
 
 
246 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.61 
 
 
248 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.41 
 
 
246 aa  278  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.78 
 
 
248 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.66 
 
 
248 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.45 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.4 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.98 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.92 
 
 
243 aa  272  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.98 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
254 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  58.4 
 
 
246 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.47 
 
 
240 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.4 
 
 
246 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.75 
 
 
247 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
248 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0031  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
244 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.17 
 
 
254 aa  268  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.12 
 
 
249 aa  268  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.54 
 
 
249 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59 
 
 
254 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1500  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  58.4 
 
 
241 aa  265  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
260 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
240 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60 
 
 
240 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1066  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.83 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0840275  normal  0.0462592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.26 
 
 
244 aa  264  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.12 
 
 
242 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.12 
 
 
242 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.28 
 
 
235 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.28 
 
 
235 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.12 
 
 
242 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
257 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.28 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
245 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.79 
 
 
255 aa  261  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>