More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0617 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
319 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  53.38 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  53.22 
 
 
310 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  50 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  51.53 
 
 
310 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  50.49 
 
 
342 aa  308  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  50 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  50.52 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
315 aa  298  6e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
315 aa  298  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.37 
 
 
311 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.37 
 
 
311 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  49.01 
 
 
311 aa  295  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  48.56 
 
 
315 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  48.04 
 
 
351 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.44 
 
 
333 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.73 
 
 
320 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  48.37 
 
 
310 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  47.28 
 
 
318 aa  286  4e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  48.46 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 
345 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  46.15 
 
 
345 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  43 
 
 
334 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  44.01 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  46.36 
 
 
311 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  49.09 
 
 
291 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  45.72 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  45.67 
 
 
330 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  43.81 
 
 
321 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  44.05 
 
 
331 aa  265  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  45.03 
 
 
333 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  47.18 
 
 
315 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  43.59 
 
 
335 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  42.36 
 
 
333 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  46.18 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  46.05 
 
 
339 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 
330 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.28 
 
 
319 aa  260  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  44.19 
 
 
326 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  44.08 
 
 
324 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  44.08 
 
 
324 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  43.12 
 
 
334 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
339 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 
326 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  42.68 
 
 
333 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  44.97 
 
 
321 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  46.62 
 
 
327 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  46.82 
 
 
324 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  42.68 
 
 
333 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  42.99 
 
 
323 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.28 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.15 
 
 
330 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  44.15 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  43.43 
 
 
320 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  46.62 
 
 
327 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 
323 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  46.15 
 
 
326 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43 
 
 
331 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  42.72 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  42.17 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  44.74 
 
 
332 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  44.67 
 
 
325 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  43.14 
 
 
330 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  43.05 
 
 
333 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  43.05 
 
 
327 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  44.71 
 
 
317 aa  250  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  43.05 
 
 
327 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  43.38 
 
 
330 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3180  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.59 
 
 
321 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
330 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  45.73 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  41.31 
 
 
319 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  43.41 
 
 
332 aa  250  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 
327 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  43.71 
 
 
322 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  43.71 
 
 
322 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  44.08 
 
 
346 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  41.67 
 
 
340 aa  248  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45.07 
 
 
324 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  43.81 
 
 
321 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  45.61 
 
 
327 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  45.73 
 
 
321 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  39.12 
 
 
331 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  43.42 
 
 
327 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  43.05 
 
 
321 aa  245  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.37 
 
 
344 aa  245  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  43.52 
 
 
332 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3040  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.29 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>