More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0596 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  100 
 
 		 730 aa  1488    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  44.63 
 
 		 790 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  44.29 
 
 		 796 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  45.73 
 
 		 791 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  44.82 
 
 		 781 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  45.18 
 
 		 742 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  43.78 
 
 		 787 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  43.14 
 
 		 768 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  44.69 
 
 		 777 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  44.22 
 
 		 764 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  43.11 
 
 		 769 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  43.93 
 
 		 764 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  44.04 
 
 		 764 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  42.9 
 
 		 779 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  43.42 
 
 		 790 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  44.94 
 
 		 833 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  45.35 
 
 		 827 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  42.73 
 
 		 790 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 		 779 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  42.05 
 
 		 791 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  42.05 
 
 		 774 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  43.23 
 
 		 768 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  42.05 
 
 		 774 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  44.08 
 
 		 826 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  41.9 
 
 		 774 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  44.08 
 
 		 826 aa  571  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  43.12 
 
 		 826 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  43.06 
 
 		 824 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  42.84 
 
 		 826 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  44.3 
 
 		 754 aa  568  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  42.46 
 
 		 789 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  41.3 
 
 		 766 aa  568  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  44.26 
 
 		 836 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  42.6 
 
 		 840 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  42.6 
 
 		 840 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  42.6 
 
 		 840 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  42.45 
 
 		 840 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  42.45 
 
 		 840 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  39.75 
 
 		 780 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  43 
 
 		 841 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  40.71 
 
 		 773 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  42.54 
 
 		 780 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  40.56 
 
 		 773 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  43.17 
 
 		 841 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  42.82 
 
 		 840 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  43.17 
 
 		 841 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  40.71 
 
 		 773 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  43.17 
 
 		 844 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  39.69 
 
 		 773 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  42.82 
 
 		 844 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  42.82 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  42.82 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  39.97 
 
 		 774 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  42.82 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  42.82 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  40.56 
 
 		 773 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  39.77 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  39.09 
 
 		 772 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  40.54 
 
 		 774 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  39.19 
 
 		 775 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  40.38 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  39.21 
 
 		 830 aa  512  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  39.67 
 
 		 778 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  40.12 
 
 		 732 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  38.78 
 
 		 759 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  39.2 
 
 		 777 aa  488  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  38.72 
 
 		 776 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  39.85 
 
 		 881 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  40.96 
 
 		 748 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  37.09 
 
 		 827 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  36.69 
 
 		 827 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 		 766 aa  435  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  35.17 
 
 		 813 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  35.09 
 
 		 814 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  33.77 
 
 		 792 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 		 792 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 757 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 766 aa  347  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  29.28 
 
 		 890 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.57 
 
 		 751 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.2 
 
 		 714 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.96 
 
 		 618 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 714 aa  299  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.27 
 
 		 806 aa  296  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.39 
 
 		 734 aa  294  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.86 
 
 		 734 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.21 
 
 		 720 aa  294  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.71 
 
 		 727 aa  292  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34.07 
 
 		 770 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 		 654 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.71 
 
 		 727 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.71 
 
 		 732 aa  291  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  34.21 
 
 		 735 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 720 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 		 625 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.81 
 
 		 643 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.81 
 
 		 643 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.15 
 
 		 728 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  33.15 
 
 		 739 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.98 
 
 		 723 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>