167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0557 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 		 213 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  37.04 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  36.95 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.91 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  35.45 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  32.17 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.45 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  31.88 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.95 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  32.17 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  32.17 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.3 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.8 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.05 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  31.33 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  29.36 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.39 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  32.96 
 
 		 271 aa  95.5  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 275 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  31.12 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  29.89 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  29.38 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.1 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.1 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  27.62 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  23.72 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  24.15 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09722  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.412545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.79 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.18 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.29 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  22.33 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.7 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  23.92 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.62 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  23.92 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.37 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.49 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>