88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0512 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 706 aa  1400    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  44.64 
 
 		 666 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.73 
 
 		 575 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  42.75 
 
 		 466 aa  248  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.19 
 
 		 659 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.92 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.04 
 
 		 682 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.05 
 
 		 680 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  34.02 
 
 		 548 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  34.56 
 
 		 676 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.68 
 
 		 824 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.49 
 
 		 684 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.45 
 
 		 830 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.19 
 
 		 529 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.6 
 
 		 680 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.57 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.59 
 
 		 674 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.47 
 
 		 587 aa  173  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.84 
 
 		 693 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.89 
 
 		 1537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.93 
 
 		 404 aa  167  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 691 aa  154  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.14 
 
 		 486 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  48.68 
 
 		 1011 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.15 
 
 		 627 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.73 
 
 		 609 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1022 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  32.13 
 
 		 444 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  41.57 
 
 		 635 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  41.57 
 
 		 635 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  42.93 
 
 		 634 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.61 
 
 		 449 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  39.71 
 
 		 1376 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  26.17 
 
 		 651 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  32.28 
 
 		 645 aa  104  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  31.82 
 
 		 431 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  29.67 
 
 		 396 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.2 
 
 		 406 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 833 aa  94.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  29.57 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3452  hypothetical protein  32.98 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153341  normal  0.241088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  42.2 
 
 		 1004 aa  77.4  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.53 
 
 		 595 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35.64 
 
 		 855 aa  72  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  45.56 
 
 		 143 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  42.45 
 
 		 835 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  32.97 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1750 aa  65.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  36.02 
 
 		 848 aa  63.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  26.79 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  33.51 
 
 		 868 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.12 
 
 		 1672 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 		 868 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.98 
 
 		 867 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  32.66 
 
 		 972 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  32.35 
 
 		 232 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  33.16 
 
 		 1771 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 868 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  35.42 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  36.84 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.83 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1432  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1175 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.974994  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  31.38 
 
 		 868 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 863 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.85 
 
 		 868 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  33.19 
 
 		 848 aa  54.7  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.21 
 
 		 3197 aa  54.3  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.26 
 
 		 1348 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.68 
 
 		 1107 aa  52.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1608 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  27.86 
 
 		 458 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.89 
 
 		 3197 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.53 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  31.91 
 
 		 460 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 1212 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1601 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  24.93 
 
 		 1337 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  39.36 
 
 		 746 aa  47.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  31.96 
 
 		 861 aa  47.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  26.29 
 
 		 1069 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.55 
 
 		 869 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  34.43 
 
 		 969 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  26.12 
 
 		 1433 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  28.12 
 
 		 937 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38.54 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  32.47 
 
 		 400 aa  44.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  40.28 
 
 		 994 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  27.73 
 
 		 1538 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>