More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0449 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0449  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 334 aa  688    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0213418  decreased coverage  0.00105166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3404  glycosyl transferase family 2  49.85 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4311  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.536984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3451  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0242302  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2193  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0676402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  25.08 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  24.42 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3309  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0235179  normal  0.32475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.31 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.8 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.8 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  25.8 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.8 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  22.26 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1606  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.44 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  23.27 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  21.48 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  23.34 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  25.73 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.63 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  20.63 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  25.44 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1473  hypothetical protein  25.7 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  25.39 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  23.89 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  23.84 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.24 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2344  glycosyl transferase family 2  21.94 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  24.14 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  24.61 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.61 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.61 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  24.61 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.61 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4183  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.61 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  22.65 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.61 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  28.3 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  22.83 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2754  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  20.45 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  23.62 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  23.24 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>