42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0433 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  100 
 
 		 668 aa  1395    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  29.31 
 
 		 627 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  25.08 
 
 		 627 aa  184  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  23.77 
 
 		 630 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  25.26 
 
 		 675 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  27.12 
 
 		 702 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  27.27 
 
 		 702 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  26.29 
 
 		 702 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  22.6 
 
 		 630 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  26.39 
 
 		 657 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  24.2 
 
 		 557 aa  106  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  25.06 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02344  hypothetical protein  24.4 
 
 		 612 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  21.68 
 
 		 651 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  24.25 
 
 		 587 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  23.08 
 
 		 651 aa  95.5  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  24.25 
 
 		 670 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  24.05 
 
 		 561 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1124  Heparinase II/III family protein  23.82 
 
 		 616 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  23.06 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  24.47 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  19.23 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  31.18 
 
 		 680 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  22.98 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  19.44 
 
 		 672 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  21.45 
 
 		 760 aa  70.5  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  22.02 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  22.65 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  21.68 
 
 		 545 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  21.72 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  21.72 
 
 		 908 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  21.72 
 
 		 896 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  19.57 
 
 		 594 aa  57  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  25.63 
 
 		 1260 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  20.59 
 
 		 600 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  21.55 
 
 		 906 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  25.81 
 
 		 524 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  32.46 
 
 		 968 aa  51.2  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  19.14 
 
 		 634 aa  51.2  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  30.1 
 
 		 617 aa  51.2  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0251  heparinase II/III-like  35.05 
 
 		 772 aa  47.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.884612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  33 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>