More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0337 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  100 
 
 
100 aa  207  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  53.61 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  53.61 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  53.61 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  53.06 
 
 
107 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  51 
 
 
106 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  50.52 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  50 
 
 
106 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  50.52 
 
 
108 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  50.52 
 
 
108 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  50.52 
 
 
108 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  50.52 
 
 
108 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  49.48 
 
 
108 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  47.92 
 
 
109 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  47.92 
 
 
109 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  47.92 
 
 
109 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  53.16 
 
 
106 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  46.88 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
110 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  43.3 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  48.45 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  44.33 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 
101 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  46.39 
 
 
107 aa  94  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
101 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  46.94 
 
 
106 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 
123 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
101 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
101 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
101 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
110 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  47.31 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  48.75 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  53.33 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  49.33 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  43.88 
 
 
109 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  48 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 
109 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  48.05 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  43.9 
 
 
102 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  48 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  41.67 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  41.77 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  46.05 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  38.3 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  39.8 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
656 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 
263 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  32.93 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  38.36 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  34.78 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 
272 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
260 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  29.79 
 
 
254 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  29.17 
 
 
260 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  33.73 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.99 
 
 
379 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
277 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  33.73 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.11 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.67 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.14 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  32.89 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>