More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0233 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  100 
 
 
179 aa  362  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  64.94 
 
 
182 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  64.94 
 
 
182 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  65.52 
 
 
182 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  65.73 
 
 
182 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  65.52 
 
 
182 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  64.94 
 
 
182 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  64.94 
 
 
182 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  64.94 
 
 
182 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  64.94 
 
 
182 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  62.86 
 
 
185 aa  237  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  63.79 
 
 
182 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  60.67 
 
 
185 aa  229  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  62.43 
 
 
184 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  60.92 
 
 
184 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  62.79 
 
 
181 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  61.49 
 
 
177 aa  228  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  58.62 
 
 
181 aa  222  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  59.55 
 
 
178 aa  220  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  60 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  58.48 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  57.39 
 
 
184 aa  218  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  58.72 
 
 
179 aa  217  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  55.11 
 
 
180 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  60.67 
 
 
180 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  58.29 
 
 
182 aa  217  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  59.22 
 
 
184 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  59.22 
 
 
184 aa  216  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  59.22 
 
 
184 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  59.22 
 
 
256 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  59.22 
 
 
293 aa  216  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  59.22 
 
 
256 aa  216  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  55.43 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  58.05 
 
 
183 aa  214  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  58.66 
 
 
184 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  58.66 
 
 
184 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  57.47 
 
 
182 aa  214  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  55.43 
 
 
180 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  58.66 
 
 
184 aa  213  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  53.14 
 
 
181 aa  213  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  52 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  52 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  59.88 
 
 
176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  55.75 
 
 
192 aa  210  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  57.87 
 
 
180 aa  209  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  55.62 
 
 
184 aa  207  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  54.86 
 
 
179 aa  207  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  57.87 
 
 
180 aa  207  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  55.23 
 
 
178 aa  207  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  54.91 
 
 
177 aa  207  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  57.87 
 
 
180 aa  207  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  57.87 
 
 
180 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  54.07 
 
 
179 aa  206  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  54.07 
 
 
185 aa  206  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  52 
 
 
180 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  56.74 
 
 
178 aa  204  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  50.86 
 
 
182 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  50.86 
 
 
182 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  50.86 
 
 
182 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  51.15 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.45 
 
 
185 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  53.14 
 
 
180 aa  187  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  51.16 
 
 
179 aa  184  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  50.29 
 
 
176 aa  184  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  49.42 
 
 
176 aa  184  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  50.87 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  50.58 
 
 
187 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  50.58 
 
 
187 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  50.85 
 
 
181 aa  177  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  50.29 
 
 
169 aa  177  9e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  51.45 
 
 
187 aa  177  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  51.83 
 
 
189 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  47.75 
 
 
182 aa  175  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  47.19 
 
 
182 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  47.19 
 
 
182 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  48.54 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  48.31 
 
 
174 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  45.51 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  44.94 
 
 
175 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  44.38 
 
 
175 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  42.69 
 
 
183 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  46.86 
 
 
179 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  44.64 
 
 
185 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  45.09 
 
 
177 aa  153  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  45.66 
 
 
177 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  46.24 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  41.48 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  46.71 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.93 
 
 
177 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  48.41 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  44.32 
 
 
167 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  46.82 
 
 
175 aa  150  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 
178 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  43.75 
 
 
167 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  43.45 
 
 
170 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  41.07 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.12 
 
 
166 aa  144  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  39.31 
 
 
182 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  45.81 
 
 
163 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  44.59 
 
 
184 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>