155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0170 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  56.69 
 
 
131 aa  150  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  56.69 
 
 
137 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  49.26 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  54.33 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  43.7 
 
 
137 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  51.85 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  45 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  46.3 
 
 
223 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  43.93 
 
 
225 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  37.68 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  37.68 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  50 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  39.57 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  40.16 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  38.35 
 
 
167 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  38.3 
 
 
142 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  40.15 
 
 
136 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  38.18 
 
 
216 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  42.11 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  43.51 
 
 
181 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  43.36 
 
 
293 aa  84.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  37.27 
 
 
273 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  38.13 
 
 
180 aa  84.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  38.13 
 
 
179 aa  84.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  34.29 
 
 
140 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  38.64 
 
 
147 aa  83.6  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  34.75 
 
 
295 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  34.75 
 
 
295 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  34.75 
 
 
295 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  33.57 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  37.86 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  34.29 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  38.58 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  45.95 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  45.24 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  44.59 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  46.15 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  47.22 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  38.53 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  44.44 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  46.05 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  34.48 
 
 
298 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  34.48 
 
 
297 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  34.56 
 
 
297 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  36.17 
 
 
300 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
302 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  40.77 
 
 
299 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  36.84 
 
 
302 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  38.14 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  41.67 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  40.28 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  40.28 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  44.44 
 
 
266 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  30.81 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  32.62 
 
 
296 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  46.05 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  46.05 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  40.28 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  47.14 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  34.11 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  37.84 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  35.21 
 
 
298 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  38.89 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  42.98 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  42.67 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  38.21 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  40.28 
 
 
90 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  41.33 
 
 
97 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  42.25 
 
 
97 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  35.46 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  34.51 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  40.51 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  41.89 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  42.25 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  41.1 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  41.1 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  40.23 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  39.53 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  42.31 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  38.67 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  37.33 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  37.5 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  40.26 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  36.52 
 
 
294 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  41.33 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  38.67 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  38.67 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  38.96 
 
 
537 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  38.96 
 
 
537 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  38.16 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  38.67 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  31.58 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  38.67 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  50.85 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  38.16 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>