233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0082 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 
481 aa  958    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  60.67 
 
 
481 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  59.62 
 
 
481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  57.32 
 
 
481 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  56.9 
 
 
480 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  56.07 
 
 
480 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  56.9 
 
 
480 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  56.39 
 
 
480 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  55.97 
 
 
480 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  56.18 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  55.77 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  55.56 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  54.6 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  55.77 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  55.77 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  55.77 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  55.56 
 
 
480 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  55.32 
 
 
480 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  54.49 
 
 
480 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  48.61 
 
 
484 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  48.61 
 
 
484 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  49.04 
 
 
484 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  50.11 
 
 
483 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  47.97 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  47.76 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  49.06 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  48.61 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 
484 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  47.55 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  49.69 
 
 
483 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  48.65 
 
 
484 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  46.46 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  51.93 
 
 
484 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.82 
 
 
472 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  46.67 
 
 
484 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  48.42 
 
 
484 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  44.47 
 
 
481 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  44.91 
 
 
490 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  39.75 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  38.49 
 
 
482 aa  342  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  48.65 
 
 
493 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  40.16 
 
 
485 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  40 
 
 
498 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.96 
 
 
466 aa  316  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  40.81 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  38.68 
 
 
500 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  34.52 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  44.47 
 
 
510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  39.87 
 
 
466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.68 
 
 
478 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  38.11 
 
 
484 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  35.07 
 
 
482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  39.05 
 
 
498 aa  289  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  34.73 
 
 
481 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  35.51 
 
 
484 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.02 
 
 
479 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.57 
 
 
478 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  34.35 
 
 
466 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.34 
 
 
488 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  36.49 
 
 
498 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.48 
 
 
485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  34.71 
 
 
485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  34.94 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  36.7 
 
 
485 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  38.28 
 
 
494 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  33.68 
 
 
479 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.84 
 
 
485 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.48 
 
 
481 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.91 
 
 
483 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.48 
 
 
491 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  36.58 
 
 
483 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  32.02 
 
 
482 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  36.34 
 
 
495 aa  262  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.24 
 
 
483 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  40.19 
 
 
484 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  35.04 
 
 
485 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  34.93 
 
 
482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  35 
 
 
484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  33.61 
 
 
482 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  33.61 
 
 
482 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  34.24 
 
 
482 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.66 
 
 
485 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  33.68 
 
 
485 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.66 
 
 
485 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  31.91 
 
 
483 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  38.6 
 
 
484 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.45 
 
 
485 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  34.17 
 
 
484 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.7 
 
 
488 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  34.17 
 
 
484 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.7 
 
 
488 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.41 
 
 
483 aa  256  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  35.97 
 
 
488 aa  256  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  34.23 
 
 
491 aa  256  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  37.69 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  35.05 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  33.67 
 
 
485 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.02 
 
 
481 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  35.07 
 
 
486 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.02 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>