More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0049 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  100 
 
 
330 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.31 
 
 
306 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  62.31 
 
 
306 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.36 
 
 
275 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.94 
 
 
275 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.3 
 
 
301 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.69 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  53.39 
 
 
285 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  47.04 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.4 
 
 
279 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  48.73 
 
 
279 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.87 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.48 
 
 
279 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  54.09 
 
 
283 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
289 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.6 
 
 
279 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  55.29 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 
296 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
284 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
284 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.51 
 
 
289 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
284 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.79 
 
 
279 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
321 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.37 
 
 
293 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
272 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.54 
 
 
282 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  47.39 
 
 
282 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.71 
 
 
269 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
283 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  50.22 
 
 
283 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  50.22 
 
 
253 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  50.22 
 
 
283 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  50.22 
 
 
253 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  50 
 
 
283 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  50.22 
 
 
285 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  53.74 
 
 
275 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
275 aa  232  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
275 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
275 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
275 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  51.42 
 
 
275 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 
412 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  51.01 
 
 
275 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  50.61 
 
 
275 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  50.61 
 
 
275 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  47.81 
 
 
272 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  51.42 
 
 
275 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.99 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  48.25 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.92 
 
 
280 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  50.61 
 
 
261 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
430 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
257 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
257 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
288 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
255 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
262 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.76 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
284 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
259 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
283 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
289 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
286 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
291 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.32 
 
 
256 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
274 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.48 
 
 
252 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
264 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
260 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 
288 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
254 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
284 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
296 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  36.4 
 
 
274 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
279 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.85 
 
 
279 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
286 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
277 aa  152  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  36.05 
 
 
264 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
264 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  36.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
286 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
286 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0961261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.15 
 
 
260 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
263 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
281 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
278 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
274 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
265 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
265 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>