84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0035 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0035  major facilitator transporter  100 
 
 		 808 aa  1614    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0511713  decreased coverage  0.0019821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3333  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 568 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.901115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2408  major facilitator superfamily MFS_1  19.05 
 
 		 856 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2962  major facilitator superfamily transporter  25.38 
 
 		 980 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 968 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 401 aa  55.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.01 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.84 
 
 		 515 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  21.53 
 
 		 455 aa  52.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2524  major facilitator transporter  18.03 
 
 		 661 aa  51.2  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 408 aa  50.8  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  37.97 
 
 		 457 aa  50.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.06 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  30.51 
 
 		 511 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  20.19 
 
 		 424 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 397 aa  48.5  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  24.82 
 
 		 436 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 471 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  22.44 
 
 		 495 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 471 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  28.85 
 
 		 445 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 471 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 397 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 399 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 462 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 462 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 515 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0610  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  25.19 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 493 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 433 aa  47  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 471 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.95 
 
 		 627 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  21.14 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 523 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 452 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 405 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  28.57 
 
 		 217 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 474 aa  46.2  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 534 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 457 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 446 aa  45.8  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 495 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  21.85 
 
 		 442 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  26.09 
 
 		 448 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  23.77 
 
 		 446 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.86 
 
 		 521 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 472 aa  45.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  21.85 
 
 		 442 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  26.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 401 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  26.76 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  26.76 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  26.76 
 
 		 539 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 487 aa  45.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  21.85 
 
 		 442 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 483 aa  45.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 530 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 480 aa  44.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.66 
 
 		 511 aa  44.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  21.95 
 
 		 403 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  37.66 
 
 		 483 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 483 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 489 aa  44.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 498 aa  44.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.86 
 
 		 690 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 		 474 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 495 aa  44.3  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 488 aa  44.3  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>