More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0033 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0033  sensor protein  100 
 
 		 599 aa  1224    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.874201  hitchhiker  0.00904791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  24.7 
 
 		 785 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  26.15 
 
 		 786 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  25.66 
 
 		 786 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  22.81 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 		 817 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 		 817 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  24.78 
 
 		 670 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  24.78 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  23.45 
 
 		 967 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  23.45 
 
 		 967 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  22.76 
 
 		 716 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  24.92 
 
 		 840 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4674  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3597  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  0.378972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.27 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  21.05 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.92 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.92 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  22.87 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0979  putative transmembrane nitrate/nitrite sensor kinase transcription regulator protein  35.23 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  34.23 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  32.04 
 
 		 671 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  26.98 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 660 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  23.51 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.75 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  42.03 
 
 		 713 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  22.64 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  21.84 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  34.04 
 
 		 660 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  20.24 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  23.58 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.33 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.98 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  22.75 
 
 		 705 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  32.98 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2685  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.67 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1735  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  33.67 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1518  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.67 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233723  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2763  putative nitrate/nitrite sensor protein  33.67 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2629  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.67 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3073  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.67 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2245  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.67 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.482228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  31.91 
 
 		 660 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1850  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  33.67 
 
 		 644 aa  57  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.59 
 
 		 1332 aa  57  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  25.47 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  21.11 
 
 		 648 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  21.43 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.17 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  54.55 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  32.86 
 
 		 544 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.96 
 
 		 603 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  24.09 
 
 		 663 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 548 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5065  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  25.95 
 
 		 675 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.65 
 
 		 815 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  28.78 
 
 		 548 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 548 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 		 731 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1076  sensor protein  32.61 
 
 		 630 aa  54.7  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  26.09 
 
 		 643 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 792 aa  54.7  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.67 
 
 		 483 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6191  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 627 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0297171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.71 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  24.56 
 
 		 817 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 639 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  26.35 
 
 		 613 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 		 660 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 612 aa  54.3  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  26.32 
 
 		 613 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.26 
 
 		 604 aa  54.3  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1510  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.25 
 
 		 573 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 609 aa  54.3  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  34.29 
 
 		 660 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.79 
 
 		 613 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.71 
 
 		 650 aa  53.9  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  37.14 
 
 		 660 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  30.83 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000510  nitrate/nitrite sensor protein  29.89 
 
 		 578 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  24.66 
 
 		 566 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.25 
 
 		 644 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.82 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05380  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.74 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.82 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.82 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 641 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 639 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>