175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0021 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1217    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.864029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  25.75 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  25.79 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  27.24 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  25.12 
 
 		 588 aa  210  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  26.94 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  25.67 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  24.55 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  25 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  25.49 
 
 		 582 aa  203  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  24.75 
 
 		 588 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  23.51 
 
 		 617 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  24.43 
 
 		 588 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  24.17 
 
 		 589 aa  188  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  23.67 
 
 		 588 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  23.19 
 
 		 617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  23.36 
 
 		 588 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  23.58 
 
 		 606 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  23.58 
 
 		 606 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  23.93 
 
 		 588 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  23.96 
 
 		 616 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  23.96 
 
 		 616 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  23.37 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  24.03 
 
 		 595 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  23.96 
 
 		 616 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  22.73 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  24.31 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  23.53 
 
 		 595 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  22.96 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  22.79 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  23.28 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  22.96 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  22.96 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  22.96 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  22.96 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  22.79 
 
 		 580 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  23.59 
 
 		 583 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  23.98 
 
 		 585 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  23.62 
 
 		 610 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  24.44 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  22.22 
 
 		 606 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  22.22 
 
 		 606 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  22.22 
 
 		 606 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  22.38 
 
 		 606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  23.56 
 
 		 606 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  23.41 
 
 		 612 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  24.36 
 
 		 587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  23.41 
 
 		 612 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  23.97 
 
 		 612 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  23.46 
 
 		 612 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  23.41 
 
 		 612 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  23.41 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  23.41 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  24.36 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  22.71 
 
 		 616 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  24.2 
 
 		 587 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  21.39 
 
 		 610 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  22.08 
 
 		 592 aa  141  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  24.04 
 
 		 587 aa  140  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  22.53 
 
 		 526 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  24.01 
 
 		 605 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  24.13 
 
 		 607 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  23.79 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  24.29 
 
 		 623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  22.82 
 
 		 590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  24.29 
 
 		 623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  24.29 
 
 		 623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  24.49 
 
 		 623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  24.29 
 
 		 623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  24.49 
 
 		 623 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  24.33 
 
 		 623 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  23.46 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  22.87 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  22.02 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  23 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  23.71 
 
 		 589 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  21.27 
 
 		 611 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  21.27 
 
 		 611 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  21.27 
 
 		 611 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  22.2 
 
 		 611 aa  130  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  21.45 
 
 		 611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  23.27 
 
 		 604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  21.11 
 
 		 611 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  23.76 
 
 		 623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  20.95 
 
 		 611 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  23.47 
 
 		 608 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  23.07 
 
 		 620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  21.44 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  21.58 
 
 		 590 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  21.88 
 
 		 605 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  22.85 
 
 		 654 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  21.09 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  21.88 
 
 		 605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  22 
 
 		 593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  23.58 
 
 		 624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  21.88 
 
 		 605 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  22.52 
 
 		 639 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  23.28 
 
 		 628 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  21.82 
 
 		 597 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  21.82 
 
 		 597 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>