71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0017 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 1140 aa  2321    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1154 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1150 aa  246  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1133 aa  193  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1134 aa  190  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  19.19 
 
 		 1296 aa  168  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1328 aa  141  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1334 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1355 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1322 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1299 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1319 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1525 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  22.58 
 
 		 1179 aa  67  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 1209 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 1209 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1208 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  20.95 
 
 		 1204 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  19.2 
 
 		 1270 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  23 
 
 		 1175 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  20.19 
 
 		 830 aa  56.2  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  23 
 
 		 1175 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  19.59 
 
 		 1310 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1195 aa  55.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  21.25 
 
 		 1288 aa  54.7  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.4 
 
 		 1302 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  20.78 
 
 		 1168 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  18.43 
 
 		 1192 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  18.37 
 
 		 1205 aa  53.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  18.75 
 
 		 830 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  20 
 
 		 1211 aa  52.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1267 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  19.6 
 
 		 1179 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  20.28 
 
 		 1176 aa  51.6  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  18.34 
 
 		 1172 aa  51.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  19.23 
 
 		 1102 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  20.7 
 
 		 1268 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  25.4 
 
 		 1302 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  17.51 
 
 		 1181 aa  50.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  20.85 
 
 		 1267 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  20 
 
 		 1176 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  29.57 
 
 		 1164 aa  49.3  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1297 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  19.5 
 
 		 1157 aa  48.9  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  22.19 
 
 		 1313 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2901  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1271 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.839011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  20.45 
 
 		 1209 aa  48.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  20.36 
 
 		 1265 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  20.42 
 
 		 1301 aa  47.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  20.88 
 
 		 1313 aa  46.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1313 aa  46.2  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  18.18 
 
 		 831 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  18.18 
 
 		 1171 aa  45.8  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.53 
 
 		 1230 aa  46.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  22.01 
 
 		 1315 aa  45.8  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  19.42 
 
 		 1207 aa  45.8  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  17.26 
 
 		 1220 aa  45.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1315 aa  45.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  18.66 
 
 		 831 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>