164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0012 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  991  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  56.69 
 
 
492 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  56.69 
 
 
491 aa  573  1e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  56.9 
 
 
491 aa  573  1e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  56.49 
 
 
492 aa  573  1e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  56.49 
 
 
491 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  54.98 
 
 
492 aa  562  1e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  54.66 
 
 
493 aa  564  1e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  53.75 
 
 
491 aa  559  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  54.39 
 
 
491 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  55.09 
 
 
496 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  53.62 
 
 
492 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  54.81 
 
 
493 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  54.68 
 
 
496 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  54.07 
 
 
496 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  52.97 
 
 
491 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  52.92 
 
 
491 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  53.57 
 
 
760 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  53.57 
 
 
508 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  53.57 
 
 
499 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  53.57 
 
 
499 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  53.57 
 
 
508 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  53.57 
 
 
499 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  53.57 
 
 
508 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  52.94 
 
 
494 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  53.67 
 
 
492 aa  541  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  54.64 
 
 
491 aa  538  1e-152  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  53.26 
 
 
508 aa  539  1e-152  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  53.36 
 
 
491 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  53.36 
 
 
493 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  53.36 
 
 
493 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  53.36 
 
 
491 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  53.36 
 
 
493 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  53.04 
 
 
492 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  51.87 
 
 
492 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  53.15 
 
 
492 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  52.41 
 
 
490 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  52.41 
 
 
490 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  48.1 
 
 
482 aa  502  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  42.23 
 
 
525 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  40.88 
 
 
513 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  39.02 
 
 
515 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  41.42 
 
 
515 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  40.69 
 
 
517 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  39.66 
 
 
535 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  38.54 
 
 
516 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  40.23 
 
 
514 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  40 
 
 
516 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  40 
 
 
516 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  40.37 
 
 
512 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  41.7 
 
 
504 aa  363  4e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  40 
 
 
512 aa  362  7e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  1.00045e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  38.56 
 
 
498 aa  350  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  38.39 
 
 
512 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  38.3 
 
 
499 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  37.84 
 
 
494 aa  340  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.22545e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  39.36 
 
 
498 aa  336  6e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  38.43 
 
 
499 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  39.38 
 
 
496 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  37.99 
 
 
498 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.005e-08 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  37.99 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  37.99 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  37.99 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  38.08 
 
 
495 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  39.17 
 
 
496 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.70497e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  37.92 
 
 
496 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  39.17 
 
 
496 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  37.5 
 
 
501 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  38.96 
 
 
496 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  38.96 
 
 
496 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  38.96 
 
 
496 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  38.17 
 
 
496 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  38.96 
 
 
496 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  2.82714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.95 
 
 
495 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  37.82 
 
 
499 aa  327  4e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  36.18 
 
 
497 aa  325  8e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  36.96 
 
 
497 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01020  hypothetical protein  37.69 
 
 
498 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.34 
 
 
496 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.26238e-06  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0156  hypothetical protein  37.47 
 
 
498 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  37.83 
 
 
502 aa  323  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  36.96 
 
 
497 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  37.5 
 
 
500 aa  322  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  37.5 
 
 
500 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  37.5 
 
 
500 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  35.87 
 
 
500 aa  322  9e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  38.19 
 
 
499 aa  321  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  38.19 
 
 
499 aa  321  2e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  38.19 
 
 
499 aa  321  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0454  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  37.61 
 
 
502 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  38.19 
 
 
499 aa  321  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  38.05 
 
 
497 aa  320  4e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  36.96 
 
 
497 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  37.82 
 
 
500 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>